El Directorio es el máximo órgano de gobierno. Lo integran representantes de todos los socios fundadores — ministerios, colegios profesionales, universidades y empresa privada — quienes definen la dirección estratégica, aprueban el presupuesto y supervisan la gestión institucional. Se reúne en sesiones ordinarias y extraordinarias a lo largo del año.
El Comité Ejecutivo es un subcomité del Directorio integrado por ocho de sus miembros. Funciona entre sesiones del pleno: revisa el avance de programas, toma decisiones operativas y canaliza temas hacia el Directorio completo cuando corresponde.
La Dirección Ejecutiva es el equipo profesional permanente del IC. Su Director Ejecutivo implementa los acuerdos del Directorio, coordina los convenios con el sector público y privado, y representa institucionalmente al IC.
Los equipos de programas gestionan las iniciativas estratégicas más grandes del IC: el Programa Construye 2025 y la Certificación Edificio Sustentable (CES). Trabajan bajo la supervisión de la Dirección Ejecutiva.
